多級質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)是通過對一級或上級質(zhì)譜產(chǎn)生離子的進一步裂解產(chǎn)生次級質(zhì)譜，并對次級質(zhì)譜進行質(zhì)量分析技術(shù)。

依據(jù)實現(xiàn)方式，多級質(zhì)譜儀可分為兩類：

一，時間串聯(lián)質(zhì)譜，它是利用某些質(zhì)量分析器能夠儲存離子的特性，在同一個質(zhì)量分析器上，通過時間序貫實現(xiàn)多級質(zhì)譜分析；

二，空間串聯(lián)質(zhì)譜，它是利用多個質(zhì)量分析器在空間上串聯(lián)從而實現(xiàn)多級質(zhì)譜的功能  。

時間串聯(lián)質(zhì)譜
時間串聯(lián)質(zhì)譜需要質(zhì)量分析器具有捕獲并駐留離子的特性，如離子阱、傅里葉變換離子回旋共振就是這類質(zhì)量分析器，它們通過將不檢測離子噴射出質(zhì)譜質(zhì)量分析器的分析區(qū)，孤立待分析的離子做進一步的裂解，從而獲得次級質(zhì)譜，這一個過程可以反復，這樣可以觀測幾代子代離子的碎片，因此時間型質(zhì)譜可進行多級子離子實驗。它的局限性在于不能實現(xiàn)多級質(zhì)譜的另外一些重要性能如母離子掃描或中性丟失實驗等 。

空間串聯(lián)質(zhì)譜
空間串聯(lián)質(zhì)譜是利用多個質(zhì)量分析器在空間上串聯(lián)，來實現(xiàn)多級質(zhì)譜功能。如三重四級桿(QqQ)，它由Q1和Q3兩個四級桿質(zhì)量分析器外加Q2做碰撞誘導裂解組成，共同實現(xiàn)二級質(zhì)譜的功能。這種多重質(zhì)量分析器組合，通常第一質(zhì)量分析器設計為射頻質(zhì)譜，如四級桿或離子阱，第二質(zhì)量分析器質(zhì)量分析器則根據(jù)應用目的，可以設計為射頻(主要為四級桿)、也可以設計為高分辨率質(zhì)量分析器如TOF或FT—MS等。不同的質(zhì)量分析器設計組合，帶來的分析特性不同，如QqQ可以進行掃描母離子、中性丟失、子離子和多反應監(jiān)測等數(shù)據(jù)采集技術(shù)：通過提高選擇性而長于定量；Q-TOF或IT-TOF通過引入TOF，將碎片離子的多級質(zhì)譜分析與離子的高分辨率質(zhì)譜相結(jié)合，更有利于定性。

多級質(zhì)譜聯(lián)用有：

氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(二手GC-MS)
液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(二手LC-MS)
毛細管電泳-質(zhì)譜聯(lián)用(CE-MS)
超臨界流體色影質(zhì)譜聯(lián)用(SFC-MS)
等離子體發(fā)射光譜-質(zhì)譜聯(lián)用(二手ICP-MS)